为了更好培养生产、建设、管理、服务第一线适用的技能型专门人才，药学系进一步拓展校企合作育人空间，联手6家知名企业，在2018级药学、中药学、药品服务与管理、药品经营与管理、药品生产技术5个专业新生中开办订单班13个，其中与益丰大药房、新汇制药在药学、中药学、药品服务与管理、药品经营与管理4个专业联合开办现代学徒制试点班7个，其中“益丰班”5个，“新汇班”2个；与老百姓大药房、养天和大药房、东门大药房在药学专业开办“店长班”5个，其中“老百姓店长班”2个，“养天和店长班”2个，“东门店长班”1个；与康普药业在药品生产技术专业开办QC班1个。订单培养521名学生，订单份额达92%。

迄今为止，药学系已与11家知名企业联合办学，开办订单班84个。